溫度
在正常環境的情況下，天然水晶的溫度是比較其他寶石為低。以手掌或面頰接觸時會感覺微冷。這分便方法只適用於比較大的水晶球或水晶棒，因為太小的水晶如水晶手鍊或墜子比較難感覺其溫度的差異。
重量
天然水晶是石頭類物質，密度高，重量不會大輕。購買水晶時先放在手上秤秤重量，發覺重量相對比較輕的有很大機會是玻璃或塑膠製成的假水晶。現在以「養晶」方法制成的水晶其重量和天然水晶十分接近，普通人是不容易分便出，只有兼併觀察其他方面例如有否「內包物」、折射度等等才可鑑別出是真是假。
折射
天然水晶是會有雙折射的。把一條黑線放在白布或白紙上，把水晶放在上，透過水晶觀看，黑線會折射為兩條平衡或重疊的黑線。如看不見雙折射的情況，很大機會這是玻璃製成的假水晶。但這方法只適用於鑑別玻璃和天然水晶的分別。現在以「養晶」方法制成的水晶也有折射率的。這方法也不適用於分便白水晶球的真偽，因為白水晶球的折射率不高，用這方法鑑別未必準確。
能量
真水晶是能夠發出能量的。購買水晶柱時，用一隻手拿起以柱尖向著另一隻手的手心，距離2至3吋左右順時針方向慢慢打圈。手心能夠感覺到水晶柱發放的能量射向手掌，感覺是很明顯的。當然有小部分人對水晶的能量感應比較弱，初初接觸水晶時未能感應其能量，這方法並不適用。但如果你用這方法又能夠感覺到水晶發出的能量，這可確定手上的必然是真正的天然水晶。
內包物
任何天然水晶都有「內包物」的(即礦物質或氣泡)，只分別在「內包物」的種類和大小而已。這些「內包物」或多或少，肉眼已經可以看得見。如果看見晶瑩剔透的水晶，原全看不見有「內包物」，這便要小心了，這可能是璃製成的假水晶。相信想購買這樣罕有的天然水晶，必須以適當的儀器鑑定才付錢購買。要算是極晶瑩剔透的水晶也必定「內包物」，以專業的顯微鏡便能夠看到了。
